RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GOLIM4	O00461	696 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ADD2	P35612	726 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PPP4C	P60510	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MECOM	Q03112	1051 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	TNIP1	Q15025	636 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	IL25	Q9H293	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MYH7	P12883	1935 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	FOXP2	O15409	715 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	EGFR	P00533	1210 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PDE6A	P16499	860 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	CHML	P26374	656 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	RGS3	P49796	1198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	RHBDL3	P58872	404 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	SCN4A	P35499	1836 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	EPS15	P42566	896 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775		A0A0D9SFI3	127 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775		G3V3G9	751 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	WNT10B	O00744	389 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	CRK	P46108	304 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	APPBP2	Q92624	585 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	SGSM2	O43147	1006 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	MAST3	O60307	1309 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775		M0R2C6	588 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	LDHC	P07864	332 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TMUB2-208	ENST00000587775	CYP7A1	P22680	504 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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