RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NUCB1	Q02818	461 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MRI	Q9BWK5	157 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DLGAP5	Q15398	846 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	WNT10B	O00744	389 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CFAP100	Q494V2	611 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LNPK	Q9C0E8	428 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CHADL	Q6NUI6	762 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CRK	P46108	304 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	40.37	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TEKT1	Q969V4	418 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPDYE6	P0CI01	402 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MX1	P20591	662 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IGSF3	O75054	1194 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FSTL1	Q12841	308 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HAUS7	Q99871	368 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RAI14	Q9P0K7	980 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MECOM	Q03112	1051 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GGA3	Q9NZ52	723 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DOCK2	Q92608	1830 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ERC2	O15083	957 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SLF2	Q8IX21	1173 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYO1B	O43795	1136 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	40.29	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	40.29	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		40.28	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CNTROB	Q8N137	903 aa		40.28	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		40.28	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GOLIM4	O00461	696 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	STAP2	Q9UGK3	403 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PDE1A	P54750	535 aa		40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GSTO1	P78417	241 aa		40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF384	Q8TF68	577 aa		40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GAK	O14976	1311 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAP3K12	Q12852	859 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LDHC	P07864	332 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AOX1	Q06278	1338 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SULF1	Q8IWU6	871 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CLRN2	A0PK11	232 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
CTDNEP1-209	ENST00000574205	C1QTNF8	P60827	252 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	USP48	Q86UV5	1035 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	VEZT	Q9HBM0	779 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		40.16	■■■■■ 4.02

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