RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552899.5

CSRNP2-208, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, human

TSL 4

Gene CSRNP2, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRNP2-208	ENST00000552899	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CAPNS2	Q96L46	248 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	SNED1	Q8TER0	1413 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899		A0A0D9SFI3	127 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	KRT85	P78386	507 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	MASTL	Q96GX5	879 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	COL4A5	P29400	1685 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	FZD9	O00144	591 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CSF1R	P07333	972 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ECE1	P42892	770 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CCDC93	Q567U6	631 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TSKS	Q9UJT2	592 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CAVIN2	O95810	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ME3	Q16798	604 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TPM3	P06753	285 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	GORAB	Q5T7V8	394 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CST9	Q5W186	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	GPC2	Q8N158	579 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	RBSN	Q9H1K0	784 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	SYCE3	A1L190	88 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	NPR1	P16066	1061 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	MAP2K2	P36507	400 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TERF1	P54274	439 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	OLFM4	Q6UX06	510 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	GTF3C6	Q969F1	213 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZNF609	O15014	1411 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSRNP2-208	ENST00000552899		A0A1B0GUL7	405 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	CA12	O43570	354 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	PFKFB2	O60825	505 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	AOC2	O75106	756 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	FGD1	P98174	961 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	GRM1	Q13255	1194 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSRNP2-208	ENST00000552899	ALDH1B1	P30837	517 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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