RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549523.5

USP15-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 5

Gene USP15, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-215ENST00000549523 GNRH1P01148 92 aa14.97□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 MAP3K9P80192 1104 aa14.97□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 TRIM47Q96LD4 638 aa14.97□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.97□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 A0A1B0GUL6 1792 aa14.97□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 GJB1P08034 283 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 PRMT2P55345 433 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 C17orf99Q6UX52 265 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 IFT57Q9NWB7 429 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 SRRDQ9UH36 339 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-215ENST00000549523 KCNJ4P48050 445 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 TNFAIP1Q13829 316 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 TSPYL6Q8N831 410 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 STAP2Q9UGK3 403 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 MUC3AQ02505 3323 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 IRF6O14896 467 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 CCL5P13501 91 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 OSBPP22059 807 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 GCKRQ14397 625 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 KIF22Q14807 665 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 Q7L0L9 218 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 CETPP11597 493 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 GRK4P32298 578 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 G2E3Q7L622 706 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 TTC28Q96AY4 2481 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 EVI5O60447 810 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 PSMC4P43686 418 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 MOGSQ13724 837 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 RALBP1Q15311 655 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 GRIK5Q16478 980 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ERO1BQ86YB8 467 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 CPA4Q9UI42 421 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 CSADQ9Y600 493 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 PPIL2Q13356 520 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 SNAPC2Q13487 334 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 RNF208Q9H0X6 261 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ALPK3Q96L96 1907 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 CACNB3P54284 484 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 GNAI1P63096 354 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 MYPNQ86TC9 1320 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-215ENST00000549523 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 BMP8BP34820 402 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 CRKP46108 304 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 FOXO4P98177 505 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 PRKCZQ05513 592 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 RAET1EQ8TD07 263 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 WRNIP1Q96S55 665 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 SGPL1O95470 568 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 BCRP11274 1271 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 GDF15Q99988 308 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 PDHXO00330 501 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 GABRQQ9UN88 632 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 GYG1P46976 350 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 TNNI2P48788 182 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 UBXN2AP68543 259 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 PPATQ06203 517 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 APAF1O14727 1248 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 HOXD10P28358 340 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-215ENST00000549523 INPP5BP32019 993 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms