RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533078.5

CMTM1-216, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-216ENST00000533078 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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CMTM1-216ENST00000533078 MAP3K9P80192 1104 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 PTPN18Q99952 460 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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CMTM1-216ENST00000533078 MAST3O60307 1309 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.57□□□□□ -0.08
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CMTM1-216ENST00000533078 SNAPC2Q13487 334 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 DCAF15Q66K64 600 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 ERO1BQ86YB8 467 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
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CMTM1-216ENST00000533078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 AOX1Q06278 1338 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 PRMT2P55345 433 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 METTL24Q5JXM2 366 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 TEPSINQ96N21 525 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 WRNIP1Q96S55 665 aa14.55□□□□□ -0.08
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CMTM1-216ENST00000533078 MRS2Q9HD23 443 aa14.54□□□□□ -0.08
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CMTM1-216ENST00000533078 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 PPIL2Q13356 520 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-216ENST00000533078 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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CMTM1-216ENST00000533078 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.52□□□□□ -0.09
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CMTM1-216ENST00000533078 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 CACNB3P54284 484 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 PPATQ06203 517 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 RAET1EQ8TD07 263 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 SUCLG2Q96I99 432 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 MRIQ9BWK5 157 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 CEP290O15078 2479 aa14.51□□□□□ -0.09
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CMTM1-216ENST00000533078 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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CMTM1-216ENST00000533078 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 CAP1Q01518 475 aa14.49□□□□□ -0.09
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CMTM1-216ENST00000533078 CCDC184Q52MB2 194 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 DPF3Q92784 378 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 AK9Q5TCS8 1911 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 KIF16BQ96L93 1317 aa14.48□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 SZT2Q5T011 3432 aa14.48□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CMTM1-216ENST00000533078 PSMC4P43686 418 aa14.48□□□□□ -0.09
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