RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	FOXN1	O15353	648 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	CACNB3	P54284	484 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	PRKG1	Q13976	671 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	LAMB1	P07942	1786 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PABPC1-222	ENST00000523555	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ECE1	P42892	770 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MCAM	P43121	646 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	RASA3	Q14644	834 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO1B	O43795	1136 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC10A3	P09131	477 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MS4A1	P11836	297 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	SEMA3E	O15041	775 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB22	O15209	634 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MAST3	O60307	1309 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MAP2K2	P36507	400 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	FKBP1B	P68106	108 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	NFIA	Q12857	509 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	APBB1	O00213	710 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	LBX1	P52954	281 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	NOG	Q13253	232 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PABPC1-222	ENST00000523555	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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