RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 DLGAP5Q15398 846 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 CFAP100Q494V2 611 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 GGA3Q9NZ52 723 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 TRAF5O00463 557 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 WNT10BO00744 389 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 PI16Q6UXB8 463 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBTB22O15209 634 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 MCAMP43121 646 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SPATA5Q8NB90 893 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SNRKQ9NRH2 765 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ABCF2Q9UG63 623 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 PRDX5P30044 214 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 USP48Q86UV5 1035 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CAPNS2Q96L46 248 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ECE1P42892 770 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CRKP46108 304 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SPDYE6P0CI01 402 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CST9Q5W186 159 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 TEKT1Q969V4 418 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 MAST3O60307 1309 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ADM5C9JUS6 153 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SULF1Q8IWU6 871 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 CLRN2A0PK11 232 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 MYO1BO43795 1136 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 DLK2Q6UY11 383 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 AOX1Q06278 1338 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-214ENST00000509677 ZAP70P43403 619 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 MRIQ9BWK5 157 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 GCC1Q96CN9 775 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 VEZTQ9HBM0 779 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 RAI14Q9P0K7 980 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 AOC2O75106 756 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 IGHDP01880 384 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ABHD8Q96I13 439 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 MECOMQ03112 1051 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 TSKSQ9UJT2 592 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-214ENST00000509677 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms