RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509206.1

RNF4-211, Transcript of ring finger protein 4, human

TSL 3

Gene RNF4, Length 490 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF4-211	ENST00000509206	WNT10B	O00744	389 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	MYO1B	O43795	1136 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	SASH1	O94885	1247 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	SGPL1	O95470	568 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	CAPN2	P17655	700 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	PSMC4	P43686	418 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	GTF2A2	P52657	109 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	MAP3K12	Q12852	859 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	CCL15	Q16663	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	PODN	Q7Z5L7	613 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	PTPN18	Q99952	460 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	GDF15	Q99988	308 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	ELP3	Q9H9T3	547 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RNF4-211	ENST00000509206	CENPF	P49454	3210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	SYN1	P17600	705 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MMP14	P50281	582 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CAP1	Q01518	475 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MAP2K5	Q13163	448 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	DLGAP5	Q15398	846 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MCM10	Q7L590	875 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	IL27	Q8NEV9	243 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	OPTN	Q96CV9	577 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	SRRD	Q9UH36	339 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	BRCA2	P51587	3418 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	TLR2	O60603	784 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	NUDT7	P0C024	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	HIC1	Q14526	733 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	ZNF428	Q96B54	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	GUCD1	Q96NT3	240 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	DEFB118	Q96PH6	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	GML	Q99445	158 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	VEZT	Q9HBM0	779 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CSAD	Q9Y600	493 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	IRF6	O14896	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	NEFM	P07197	916 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CETP	P11597	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	FOSL2	P15408	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	ATP2B4	P23634	1241 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	FCGRT	P55899	365 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	NLRP10	Q86W26	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MXD3	Q9BW11	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CPA4	Q9UI42	421 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	HTT	P42858	3142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	ADCY3	O60266	1144 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	FECH	P22830	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	PRKAR2B	P31323	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	GJA5	P36382	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	DCTN1	Q14203	1278 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RNF4-211	ENST00000509206	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms