RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495594.2

LEMD1-208, Transcript of LEM domain containing 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LEMD1, Length 637 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1-208ENST00000495594 F6X3S4 739 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 SNAP23O00161 211 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 GTF2A2P52657 109 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 NBPF11Q86T75 865 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ELP3Q9H9T3 547 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 FZD1Q9UP38 647 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.99□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 CRKP46108 304 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 KIF22Q14807 665 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 DCAF15Q66K64 600 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 TEKT1Q969V4 418 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ARMC5Q96C12 935 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 JAG2Q9Y219 1238 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 KIF16BQ96L93 1317 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 DOCK1Q14185 1865 aa9.98□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 PTPRFP10586 1907 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 HTTP42858 3142 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 GJA5P36382 358 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 CCL15Q16663 113 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 METTL24Q5JXM2 366 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.97□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 CENPFP49454 3210 aa9.96□□□□□ -0.81
LEMD1-208ENST00000495594 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 GNRH1P01148 92 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 CETPP11597 493 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 GYG1P46976 350 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PRMT2P55345 433 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 MAP3K9P80192 1104 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 VGLL4Q14135 290 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 FAM83AQ86UY5 434 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 UTYO14607 1347 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PTPRCP08575 1304 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.96□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 POTEFA5A3E0 1075 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 SNAPC2Q13487 334 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 CCDC184Q52MB2 194 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 ERO1BQ86YB8 467 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 OTUD5Q96G74 571 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 SUCLG2Q96I99 432 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 TEPSINQ96N21 525 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 WRNIP1Q96S55 665 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 MRIQ9BWK5 157 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.95□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PDE8BO95263 885 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PPIL2Q13356 520 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 ZNF333Q96JL9 665 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PTPN18Q99952 460 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.94□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 BRCA2P51587 3418 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 AOX1Q06278 1338 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 TLR2O60603 784 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 SLC5A1P13866 664 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.93□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 HOXD10P28358 340 aa9.92□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LEMD1-208ENST00000495594 PPATQ06203 517 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms