RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 VAMP4O75379 141 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 MAP3K9P80192 1104 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 CCL15Q16663 113 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 TNNI2P48788 182 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 VGLL4Q14135 290 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 UBE4AQ14139 1066 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 CSADQ9Y600 493 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 GRM8O00222 908 aa26.39■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 GYG1P46976 350 aa26.39■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.39■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.39■■□□□ 1.82
NELFE-210ENST00000491139 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 CRKP46108 304 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.38■■□□□ 1.81
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NELFE-210ENST00000491139 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.37■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
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NELFE-210ENST00000491139 CCDC184Q52MB2 194 aa26.36■■□□□ 1.81
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NELFE-210ENST00000491139 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 CETPP11597 493 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 KIF22Q14807 665 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 VPS37DQ86XT2 251 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NELFE-210ENST00000491139 TLR2O60603 784 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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NELFE-210ENST00000491139 ERO1BQ86YB8 467 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 WDR63Q8IWG1 891 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 ALDH1L1O75891 902 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 GRIK5Q16478 980 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.3■■□□□ 1.8
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NELFE-210ENST00000491139 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 BTBD19C9JJ37 291 aa26.29■■□□□ 1.8
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NELFE-210ENST00000491139 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 HOOK2Q96ED9 719 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 WRNIP1Q96S55 665 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.29■■□□□ 1.8
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NELFE-210ENST00000491139 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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NELFE-210ENST00000491139 SUCLG2Q96I99 432 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 IRF6O14896 467 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 PRMT2P55345 433 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-210ENST00000491139 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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NELFE-210ENST00000491139 KAZALD1Q96I82 304 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 MRIQ9BWK5 157 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 H0YGN5 161 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 PPIL2Q13356 520 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 DCAF15Q66K64 600 aa26.24■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 METTL24Q5JXM2 366 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 MAST3O60307 1309 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 PPATQ06203 517 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.22■■□□□ 1.79
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NELFE-210ENST00000491139 C17orf99Q6UX52 265 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-210ENST00000491139 PDE8BO95263 885 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-210ENST00000491139 BCAMP50895 628 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-210ENST00000491139 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-210ENST00000491139 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
NELFE-210ENST00000491139 MRS2Q9HD23 443 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-210ENST00000491139 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
NELFE-210ENST00000491139 CPA4Q9UI42 421 aa26.2■■□□□ 1.78
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