RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM168A	Q92567	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	EDEM1	Q92611	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576		A6NHS1	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	EREG	O14944	169 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	PDGFA	P04085	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	PCSK2	P16519	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	BNIP3	Q12983	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	EDN3	P14138	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	FUT4	P22083	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CTSB	P07858	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CD8B	P10966	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	MAOB	P27338	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	PHACTR2	O75167	634 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	ASPA	P45381	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	POU4F3	Q15319	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP11A1	P05108	521 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-222	ENST00000488576	CD96	P40200	585 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ECEL1	O95672	775 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576		A0A096LPE4	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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