RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.12■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 IGKV5-2P06315 115 aa20.11■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 UBXN2AP68543 259 aa20.11■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.11■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.11■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 RUNDC1Q96C34 613 aa20.11■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM47Q96LD4 638 aa20.11■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 SNAP23O00161 211 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 SNAPC2Q13487 334 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 STAP2Q9UGK3 403 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CPA4Q9UI42 421 aa20.1■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 LAMA3Q16787 3333 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 MYPNQ86TC9 1320 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 IL1R1P14778 569 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 OSBPP22059 807 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TNNI2P48788 182 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TEPSINQ96N21 525 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.09■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 APAF1O14727 1248 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 TAF5LO75529 589 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CTGFP29279 349 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 C17orf99Q6UX52 265 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 KSR2Q6VAB6 950 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 ERO1BQ86YB8 467 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 DEFB123Q8N688 67 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.08■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.07■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 IRF6O14896 467 aa20.07■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.07■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.06■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.06■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 WRNIP1Q96S55 665 aa20.06■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.06■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 H7C1W4 665 aa20.05■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.05■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 MIER1Q8N108 512 aa20.05■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.05■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.05■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 SGPL1O95470 568 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 PPIL2Q13356 520 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 GPR153Q6NV75 609 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.04■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.03■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 PRKCZQ05513 592 aa20.03■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 Q7L0L9 218 aa20.03■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.03■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 PDHXO00330 501 aa20.02■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 IFT57Q9NWB7 429 aa20.02■□□□□ 0.8
SRPRB-204ENST00000484684 CSF1RP07333 972 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF853P0CG23 659 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 CRKP46108 304 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 FCGRTP55899 365 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 GNAI1P63096 354 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.01■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 HOOK2Q96ED9 719 aa20■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 PLIN1O60240 522 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 BMP8BP34820 402 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 PPATQ06203 517 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 GCKRQ14397 625 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 GDF15Q99988 308 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 ADGRA2Q96PE1 1338 aa19.99■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 ADCY3O60266 1144 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 CAPN2P17655 700 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 CACNB3P54284 484 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 DEFB118Q96PH6 123 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 STK31Q9BXU1 1019 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 TMOD2Q9NZR1 351 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 UNC80Q8N2C7 3258 aa19.98■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 DCAF15Q66K64 600 aa19.97■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 C7orf61Q8IZ16 206 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms