RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458191.5

HUS1-208, Transcript of HUS1 checkpoint clamp component, human

TSL 2

Gene HUS1, Length 1,304 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HUS1-208	ENST00000458191	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	FKTN	O75072	461 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	INHBE	P58166	350 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	GNAI3	P08754	354 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	FGFR2	P21802	821 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HUS1-208	ENST00000458191	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	CIAO1	O76071	339 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	LPIN2	Q92539	896 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	BCAR3	O75815	825 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SLC5A1	P13866	664 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	BCAM	P50895	628 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MEIS3	Q99687	375 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	PRKG1	Q13976	671 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TRIM27	P14373	513 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	CRK	P46108	304 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SIL1	Q9H173	461 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	RASA3	Q14644	834 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MAST3	O60307	1309 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	GNAI2	P04899	355 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TNNI2	P48788	182 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	MTX1	Q13505	466 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	GRIK5	Q16478	980 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HUS1-208	ENST00000458191	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
HUS1-208	ENST00000458191	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HUS1-208	ENST00000458191	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HUS1-208	ENST00000458191	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HUS1-208	ENST00000458191	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HUS1-208	ENST00000458191	AOX1	Q06278	1338 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HUS1-208	ENST00000458191	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.89	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms