RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGFR2P21802 821 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 NF2P35240 595 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJA5P36382 358 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD14BQ5SR56 506 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARMC9Q7Z3E5 817 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEPSINQ96N21 525 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.66□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE8BO95263 885 aa10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASA3Q14644 834 aa10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNK4Q96J92 1243 aa10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 VEZTQ9HBM0 779 aa10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYH1P12882 1939 aa10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR25O00155 361 aa10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRKP46108 304 aa10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF16BQ96L93 1317 aa10.63□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCAMP50895 628 aa10.63□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAP1Q01518 475 aa10.63□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL24Q5JXM2 366 aa10.63□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYH7P12883 1935 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYH8P13535 1937 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 EYA2O00167 538 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO1BO43795 1136 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX10P56693 466 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SREBF2Q12772 1141 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFNL1Q8IU54 200 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPN18Q99952 460 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.62□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALPK3Q96L96 1907 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNCXA6NJT0 531 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNB3P54284 484 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKTNO75072 461 aa10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNNQ9UQP3 1299 aa10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXNB2O15031 1838 aa10.6□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 INHBEP58166 350 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFAIP1Q13829 316 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 VGLL4Q14135 290 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPTNQ96CV9 577 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEIS3Q99687 375 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRIQ9BWK5 157 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELP3Q9H9T3 547 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.59□□□□□ -0.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP290O15078 2479 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCER2I3L3R5 266 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 CIAO1O76071 339 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH1A1P00352 501 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRDX5P30044 214 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRHR2Q13324 411 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.58□□□□□ -0.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS37DQ86XT2 251 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms