RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCF2Q9UG63 623 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HACL1Q9UJ83 578 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHTN1A0MZ66 631 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H7C1D1 291 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GOLIM4O00461 696 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TICAM2Q86XR7 235 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR90Q96KV7 1748 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GAKO14976 1311 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 F8W031 263 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EGFRP00533 1210 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EPHX2P34913 555 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GSTO1P78417 241 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MECOMQ03112 1051 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP3K12Q12852 859 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF384Q8TF68 577 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TEKT1Q969V4 418 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EVI5LQ96CN4 794 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAI14Q9P0K7 980 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCN9AQ15858 1988 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPDYE6P0CI01 402 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRKP46108 304 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFAP100Q494V2 611 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTC22Q5TAA0 569 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLF2Q8IX21 1173 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RRAGCQ9HB90 399 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WNT10BO00744 389 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF3CO14782 793 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDHCP07864 332 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE6AP16499 860 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBE3CQ15386 1083 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DLGAP5Q15398 846 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADD2P35612 726 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SKAP1Q86WV1 359 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CERS3Q8IU89 383 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNTROBQ8N137 903 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FSD1Q9BTV5 496 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSME4Q14997 1843 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYO1BO43795 1136 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP7A1P22680 504 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BTDP43251 543 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms