RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 PALLDQ8WX93 1383 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 CSF1RP07333 972 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 HS1BP3Q53T59 392 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 ADD2P35612 726 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA5Q8NB90 893 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.92■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 NDUFA8P51970 172 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 KIF1AQ12756 1690 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 SLC5A1P13866 664 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 NEDD4P46934 1319 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 CLIC6Q96NY7 704 aa22.9■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 CDC27P30260 824 aa22.9■■□□□ 1.26
TTLL3-210ENST00000427220 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 SIK1P57059 783 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ITPK1Q13572 414 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 MAP3K12Q12852 859 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 LCORLQ8N3X6 602 aa22.89■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC69A6NI79 296 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 PDILTQ8N807 584 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 SMC2O95347 1197 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 CYP7A1P22680 504 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 NBPF3Q9H094 633 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ELP1O95163 1332 aa22.88■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB43O43298 467 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 SLC51AQ86UW1 340 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 SPTLC2O15270 562 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM29Q14134 588 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 LPIN2Q92539 896 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.87■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 TPM2P07951 284 aa22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 C8orf37Q96NL8 207 aa22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 DCCP43146 1447 aa22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 CHRNDQ07001 517 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 COL18A1P39060 1754 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 GUCY1A2P33402 732 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 KRT40Q6A162 431 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF75DP51815 510 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 EVX2Q03828 476 aa22.83■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.83■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 ERFEQ4G0M1 354 aa22.83■■□□□ 1.25
TTLL3-210ENST00000427220 JCADQ9P266 1359 aa22.83■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.83■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 APOA5Q6Q788 366 aa22.83■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.83■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TTLL3-210ENST00000427220 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms