RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SRGAP3O43295 1099 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 BCAMP50895 628 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 LBX1P52954 281 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 ATP2B3Q16720 1220 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC102AQ96A19 550 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 COPRSQ9NQ92 184 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 HTTP42858 3142 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 AOX1Q06278 1338 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CA12O43570 354 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 GNAI2P04899 355 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SLC10A3P09131 477 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MTX1Q13505 466 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MOB2Q70IA6 237 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ZIC5Q96T25 663 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 VEZTQ9HBM0 779 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CENPFP49454 3210 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CRKP46108 304 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 GRIK5Q16478 980 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK2Q92608 1830 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MAST3O60307 1309 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 AK9Q5TCS8 1911 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TNFAIP1Q13829 316 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PRKG1Q13976 671 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TEKT1Q969V4 418 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD8Q96I13 439 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TSKSQ9UJT2 592 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SLC34A2O95436 690 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 RLBP1P12271 317 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ADORA1P30542 326 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PHKA1P46020 1223 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TFCP2Q12800 502 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 RASA3Q14644 834 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GUL7 405 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA3EO15041 775 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TNNI2P48788 182 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 FZD1Q9UP38 647 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM10P62072 90 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K11Q16584 847 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC102BQ68D86 513 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 XAGE2Q96GT9 111 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CSRNP1Q96S65 589 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.47□□□□□ -0.89
SGMS1-201ENST00000361543 TRPA1O75762 1119 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A1P11836 297 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 PRDX5P30044 214 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CACNB3P54284 484 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RASGRF1Q13972 1273 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms