RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ENKUR	Q8TC29	256 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR119	Q8TDV5	335 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM19	Q96E16	107 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MED13	Q9UHV7	2174 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	USP24	Q9UPU5	2620 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087X002	238 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM72	A0PK05	275 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM172BP	A6NC97	362 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		F5H768	121 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R1B8	84 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF432	O94892	652 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DQB1	P01920	261 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	BGLAP	P02818	100 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	UCHL1	P09936	223 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CD37	P11049	281 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GNB1	P62873	340 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OPN5	Q6U736	354 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC20B	Q86Y33	519 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6V1	Q8N148	313 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	THEM6	Q8WUY1	208 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PTH2	Q96A98	100 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51B6	Q9H340	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PRORY	Q9H606	182 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	VSIG4	Q9Y279	399 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0G2JMP0	313 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0X1KG70	313 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PHYH	O14832	338 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	LYRM1	O43325	122 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NPIPB7	O75200	414 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GRPR	P30550	384 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GLP1R	P43220	463 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB561	P49447	251 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MEST	Q5EB52	335 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NIN4	97 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ARGFX	A6NJG6	315 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IFITM5	A6NNB3	132 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C17orf51	A8MQB3	221 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C1C5	153 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TP53I11	O14683	189 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	AGPAT2	O15120	278 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PIN1P1	O15428	100 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8

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