RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 A1L4Q6 167 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CEACAM1P13688 526 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 COX11Q9Y6N1 276 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 MYO10Q9HD67 2058 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PRSS2P07478 247 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ESDP10768 282 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 METAP1P53582 386 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ATP5G2Q06055 141 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PNKDQ8N490 385 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PRSS47A8MTI9 375 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PATE3B3GLJ2 98 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ATOH7Q8N100 152 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR4A5Q8NH83 315 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 GPR35Q9HC97 309 aa8.51□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM189A5PLL7 270 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM250H0YL14 139 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TCTAP57738 103 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 COPS9Q8WXC6 57 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 SFRP2Q96HF1 295 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 NPFFO15130 113 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 NKX2-2O95096 273 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TEX38Q6PEX7 206 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 GBF1Q92538 1859 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 SYNGR1O43759 233 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 S1PR2O95136 353 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 STPG3Q8N7X2 389 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CXorf1O96002 111 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 MDP1Q86V88 176 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RASL10BQ96S79 203 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TRIP11Q15643 1979 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 H0YIZ8 118 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 KLF4O43474 513 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 COX6CP09669 75 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 STAG3L3P0CL85 134 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CCL8P80075 99 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 SIPA1L1O43166 1804 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CALHM1Q8IU99 346 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 LOXL4Q96JB6 756 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CST9LQ9H4G1 147 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RAXQ9Y2V3 346 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 K7N7A8 449 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 MPZL1O95297 269 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 NUDT3O95989 172 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM187Q14656 261 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 HTN3P15516 51 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 LHX8Q68G74 356 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 CCL13Q99616 98 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ADMP35318 185 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 KCNK17Q96T54 332 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PCSK4Q6UW60 755 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 THY1P04216 161 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00869P0C866 280 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 SMIM13P0DJ93 91 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 LYL1P12980 280 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TTC32Q5I0X7 151 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 SERF1AO75920 110 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 NDUFB4O95168 129 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-228ENST00000635853 TSPOP30536 169 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.6 ms