RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OR51H1Q8NH63 302 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OR5R1Q8NH85 324 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 FCGR3BO75015 233 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 HPRT1P00492 218 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 MOSP00540 346 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 IGKV1D-33P01593 117 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 IGKV1-33P01594 117 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 IGKV1-16P04430 117 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 IL5P05113 134 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OR4E1P0C645 316 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RPA2P15927 270 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SPNP16150 400 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 UCP1P25874 307 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CBX3Q13185 183 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 ZNF585BQ52M93 769 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CADM3Q8N126 398 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OR4S2Q8NH73 311 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TP53RKQ96S44 253 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TCF19Q9Y242 345 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CUBNO60494 3623 aa9.22□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 A0A0A6YYJ9 748 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 C9orf170A2RU37 121 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 A6NDX4 124 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 H3BUX3 64 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 CLDN34H7C241 214 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 H7C2Y5 167 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 PRAF2O60831 178 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-211ENST00000582232 SFT2D2O95562 160 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 CDS2O95674 445 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 OR5AC1P0C628 307 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 ANXA3P12429 323 aa9.21□□□□□ -0.94
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GGA3-211ENST00000582232 DHRS2Q13268 280 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 PPP1R1AQ13522 171 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 TMEM187Q14656 261 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 POU2AF1Q16633 256 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 LYG2Q86SG7 212 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 TMEM56Q96MV1 263 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 COMMD9Q9P000 198 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.21□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 BTBD17A6NE02 478 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 OR2F2O95006 317 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 SPDEFO95238 335 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 CRYZL1O95825 349 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 DHFRP00374 187 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 HRASP01112 189 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 IFNA2P01563 188 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 IGHV4-59P01825 116 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 SERPINE2P07093 398 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 CD24P25063 80 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 LPAR6P43657 344 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 HILS1P60008 231 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 SRPXP78539 464 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 TRIM16LQ309B1 348 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 SP6Q3SY56 376 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 FBLN7Q53RD9 439 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 LRTM2Q8N967 370 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 NPBQ8NG41 125 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 IL22RA2Q969J5 263 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 RITA1Q96K30 269 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.2□□□□□ -0.94
GGA3-211ENST00000582232 NF1P21359 2839 aa9.2□□□□□ -0.94
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