RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TIAM1Q13009 1591 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ARAP2Q8WZ64 1704 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 MYBPHLA2RUH7 354 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 GGT3PA6NGU5 568 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 GGTLC3B5MD39 225 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SMKR1H3BMG3 65 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM178BH3BS89 294 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC179H3BU77 68 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 K7EMT4 169 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 K7ENP7 123 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SULT2B1O00204 365 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BKO60814 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 REM1O75628 298 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 DPM2O94777 84 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SIX6O95475 246 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CXorf1O96002 111 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 PLAUP00749 431 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CA2P00918 260 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BJP06899 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35G6P0C7Q6 338 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CXCL2P19875 107 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BOP23527 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 PSMB9P28065 219 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BBP33778 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DS2P43631 304 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 MARCKSL1P49006 195 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 PGFP49763 221 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF83P51522 516 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 DIO3P55073 304 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BDP58876 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R46P59540 309 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BCP62807 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SLC38A11Q08AI6 406 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 FAM27E3Q08E93 113 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 IHHQ14623 411 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF79Q15937 498 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST2H2BEQ16778 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM52BQ4KMG9 183 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ALG10Q5BKT4 473 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TTC32Q5I0X7 151 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T2Q6IF00 324 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SBSNQ6UWP8 590 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 GAPTQ8N292 157 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 OR11H7Q8NGC8 314 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 OR8B12Q8NGG6 310 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 OR1J4Q8NGS1 313 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CT55Q8WUE5 264 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BHQ93079 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 PEBP4Q96S96 227 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BNQ99877 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BMQ99879 126 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SOSTQ9BQB4 213 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 EMC6Q9BV81 110 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SFXN3Q9BWM7 321 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CA10Q9NS85 328 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM100Q9NV29 134 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC167Q9P0B6 97 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ORC6Q9Y5N6 252 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTSL3P82987 1691 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CKAP5Q14008 2032 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SHANK3Q9BYB0 1731 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 ABCC1P33527 1531 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms