RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	MT-ND4	P03905	459 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	FCGR3A	P08637	254 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PTHLH	P12272	177 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TAS2R31	P59538	309 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	IGFBP7	Q16270	282 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	GAPT	Q8N292	157 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	NEK7	Q8TDX7	302 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	LRRC29	Q8WV35	223 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	NUDT15	Q9NV35	164 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	OPN4	Q9UHM6	478 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	POLE	Q07864	2286 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	SPTA1	P02549	2419 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	MSGN1	A6NI15	193 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	OR2AT4	A6NND4	320 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFA2	O43678	99 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PFDN1	O60925	122 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	OR2H2	O95918	312 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	IL5	P05113	134 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DMA	P28067	261 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	HRH1	P35367	487 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	GLP1R	P43220	463 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	BCAP31	P51572	246 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	XG	P55808	180 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB25	P57735	213 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TSPAN5	P62079	268 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	MPPED2	Q15777	294 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	MICB	Q29980	383 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	C6orf183	Q5T699	404 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6P435	159 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF561	Q8N587	486 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ASB13	Q8WXK3	278 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	UPRT	Q96BW1	309 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF488	Q96MN9	340 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	GON7	Q9BXV9	100 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	PPA2	Q9H2U2	334 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNOT1-222	ENST00000570139	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	TRDC	B7Z8K6	153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	SPN	P16150	400 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	CCR6	P51684	374 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DRB3	P79483	266 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	FGL1	Q08830	312 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	SSX2	Q16385	188 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	STUM	Q69YW2	141 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	TERB2	Q8NHR7	220 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	SDSL	Q96GA7	329 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNOT1-222	ENST00000570139	MMP28	Q9H239	520 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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