RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549519.5

IKZF4-208, Transcript of IKAROS family zinc finger 4, human

TSL 5

Gene IKZF4, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IKZF4-208	ENST00000549519	F2R	P25116	425 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	IFITM3	Q01628	133 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.94	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	GPR137B	O60478	399 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	HPRT1	P00492	218 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	CRYZL1	O95825	349 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	HRAS	P01112	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	AKR1C4	P17516	323 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	SLC6A1	P30531	599 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TAS2R31	P59538	309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	MMD	Q15546	238 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	NBR2	O15453	112 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	FGF16	O43320	207 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	PEX14	O75381	377 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TCRB	P04435	133 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	SERPINE2	P07093	398 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	ANXA3	P12429	323 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	LPAR6	P43657	344 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519		Q8N6K4	173 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	NPB	Q8NG41	125 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	ATG12	O94817	140 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RPA2	P15927	270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	BTC	P35070	178 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	F2RL1	P55085	397 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	DHODH	Q02127	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	RITA1	Q96K30	269 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	MTOR	P42345	2549 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IKZF4-208	ENST00000549519	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519		H0Y980	276 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	SPDEF	O95238	335 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	NQO2	P16083	231 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	PLGLA	Q15195	96 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	RRH	O14718	337 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	ERVK-16	P61578	105 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	PSG5	Q15238	335 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519		Q8N9W7	124 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	CHST1	O43916	411 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	RAMP3	O60896	148 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	NDUFA3	O95167	84 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	CNTFR	P26992	372 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	UBE2K	P61086	200 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	SP6	Q3SY56	376 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.87	□□□□□ -0.19
IKZF4-208	ENST00000549519	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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