RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SELE	P16581	610 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ID3	Q02535	119 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ATP5S	Q99766	215 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM221A	A4D161	298 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MPPED1	O15442	326 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	BCL2	P10415	239 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	UCP1	P25874	307 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FGF12	P61328	243 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997		Q6ZR03	302 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MLNR	O43193	412 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	CEBPG	P53567	150 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	HERV-K104	P61576	105 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SNX22	Q96L94	193 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SYNGR1	O43759	233 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997		M0QZK8	103 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PLAU	P00749	431 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	DYNLT3	P51808	116 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	GNG3	P63215	75 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997		Q6ZPA2	131 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997		Q6ZS49	121 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IFNA1	P01562	189 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	RAB11A	P62491	216 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	CD3E	P07766	207 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	FXYD4	P59646	89 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997		M0R143	59 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	IFNA5	P01569	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR4A8	P0C604	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SLC25A6	P12236	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	VDAC1	P21796	283 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997		E7EQL1	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	EPHA1	P21709	976 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	GAGE1	Q13065	139 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PKIB	Q9C010	78 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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