RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 EGR4Q05215 589 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 HERPUD1Q15011 391 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 IGHV3-11P01762 117 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 IL4P05112 153 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.02□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 K7ENP7 123 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 GPR183P32249 361 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 RAG2P55895 527 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-204ENST00000538708 Q96M66 194 aa8.02□□□□□ -1.13
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