RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 KBTBD11O94819 623 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 VAMP5O95183 116 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 IFNA17P01571 189 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 S100A6P06703 90 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SFTPBP07988 381 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR5AC1P0C628 307 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF806P0C7X5 589 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF728P0DKX0 622 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR5H8P0DN80 308 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SERPINA2P20848 420 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CAMLGP49069 296 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PIGPP57054 158 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 H3F3AP84243 136 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 BAXQ07812 192 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF266Q14584 549 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RAB35Q15286 201 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR8G1Q15617 311 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZS52 159 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 IL22RA2Q969J5 263 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF799Q96GE5 643 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TMEM56Q96MV1 263 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TECTBQ96PL2 329 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 S100A13Q99584 98 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SPIN2AQ99865 258 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 METTL9Q9H1A3 318 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 LIME1Q9H400 295 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 DEPPQ9NTK1 212 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 AK3Q9UIJ7 227 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MTCH2Q9Y6C9 303 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 IGSF23A1L1A6 192 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TRDCB7Z8K6 153 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 M0R036 132 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 XRCC2O43543 280 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 F10P00742 488 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HBE1P02100 147 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CST2P09228 141 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 UCP1P25874 307 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HTR5AP47898 357 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RND2P52198 227 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CLDN17P56750 224 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF616Q08AN1 781 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RSU1Q15404 277 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TGIF1Q15583 401 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NMSQ5H8A3 153 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ACER2Q5QJU3 275 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MUC21Q5SSG8 566 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FAM27BQ5VT28 67 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C1orf189Q5VU69 101 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.28□□□□□ -1.88
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