RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SMIM21Q3B7S5 101 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 FAM201AQ5SY85 155 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 REC114Q7Z4M0 266 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 ZNF525Q8N782 197 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 RBKSQ9H477 322 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 PSG11Q9UQ72 335 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 HCFC1P51610 2035 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 PKDREJQ9NTG1 2253 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 ZFP92A6NM28 416 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 CEACAM1P13688 526 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R60P59551 318 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 SPINK9Q5DT21 86 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 PRR7Q8TB68 274 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 RPRMQ9NS64 109 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 LINC00473A8K010 186 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 DFFBO76075 338 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 CD200P41217 278 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 PRSS8Q16651 343 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 OR8G2PQ6IF36 304 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 LCN15Q6UWW0 184 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 BEND4Q6ZU67 534 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 NINJ1Q92982 152 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 TVP23CQ96ET8 276 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 LURAP1Q96LR2 239 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 OR4C12Q96R67 309 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 TSTD3H0UI37 97 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 CLDN1O95832 211 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 TUBG1P23258 451 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 RAB11AP62491 216 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 SSX7Q7RTT5 188 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 C1QL4Q86Z23 238 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 CLN8Q9UBY8 286 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 SPRY3O43610 288 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 HBE1P02100 147 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 UTF1Q5T230 341 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 MOGAT3Q86VF5 341 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ODAMA1E959 279 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 RNF212BA8MTL3 300 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 C15orf65H3BRN8 121 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 TCAPO15273 167 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 KLK10O43240 276 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNF737O75373 536 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 MAS1LP35410 378 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF9Q07011 255 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNF726P1Q15940 193 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.71□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 PROP1O75360 226 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 P0C879 139 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 PRSS33Q8NF86 280 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 OR2V2Q96R30 315 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 PRSS47A8MTI9 375 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 FAM27E3Q08E93 113 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZS92 163 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 PKIAP61925 76 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 NCR3LG1Q68D85 454 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNF787Q6DD87 383 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 FAM210BQ96KR6 192 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 AGMATQ9BSE5 352 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GWJ7 208 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 LRRC30A6NM36 301 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 SRRM5B3KS81 715 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZG16O60844 167 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ITLN1Q8WWA0 313 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 FAM234AQ9H0X4 552 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WWC5 75 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 SMCO3A2RU48 225 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 LEAP2Q969E1 77 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms