RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RX4	Q99571	388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TUSC2	O75896	110 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PPY	P01298	95 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLL1	P15814	213 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TBP	P20226	339 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF8	P32971	234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RFX2	P48378	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	F2RL1	P55085	397 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CFHR3	Q02985	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YJW9	148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CTDSPL	O15194	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA3	O95167	84 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	VDAC1	P21796	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	AADAC	P22760	399 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	S100G	P29377	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HRH1	P35367	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MMD	Q15546	238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MSMO1	Q15800	293 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NBR2	O15453	112 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R19	P59542	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD4	P59646	89 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PLGLA	Q15195	96 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DPF1	Q92782	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB8	P28062	276 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS7	P47929	136 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNX1	Q01196	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CATR1	Q13166	79 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL24	O00175	119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SHOX	O15266	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PROP1	O75360	226 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DGCR2	P98153	550 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MEF2D	Q14814	521 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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