RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ATRNO75882 1429 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PQ67 120 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 F8W036 122 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ISLRO14498 428 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CHP2O43745 196 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KLRC4O43908 158 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR7C2O60412 319 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MED6O75586 246 aa3.05□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 CCNE2O96020 404 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TFPTP0C1Z6 253 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FAM228BP0C875 321 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KCNE1P15382 129 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZRU5 148 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF561Q8N587 486 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.05□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 OR52B2Q96RD2 323 aa3.05□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KIFC1Q9BW19 673 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.05□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DOK5Q9P104 306 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 VWA8A3KMH1 1905 aa3.05□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PREX2Q70Z35 1606 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SAMD9Q5K651 1589 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RTL9Q8NET4 1388 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LEUTXA8MZ59 168 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DISC1C4P0D8 188 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TSTD3H0UI37 97 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 H3BSA7 217 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MRASO14807 208 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PFDN1O60925 122 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 HERVK_113P63121 156 aa3.04□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZR03 302 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 STX19Q8N4C7 294 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR8S1Q8NH09 359 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 BOLA2Q9H3K6 86 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CEP152O94986 1710 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PLCH1Q4KWH8 1693 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RFX7Q2KHR2 1363 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
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CCL20-204ENST00000489160 OR11H12B2RN74 326 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 BHLHE40O14503 412 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DEDDO75618 318 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 IL4P05112 153 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CD5P06127 495 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR5G3P0C626 314 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PTHLHP12272 177 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CNTFRP26992 372 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MAP2K4P45985 399 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CTBP2P56545 445 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RBX1P62877 108 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 IHHQ14623 411 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CDK10Q15131 360 aa3.03□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 HES3Q5TGS1 186 aa3.03□□□□□ -1.92
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