RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.4□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 OR10C1Q96KK4 312 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-241ENST00000487169 GUCD1Q96NT3 240 aa11.4□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 PNKDQ8N490 385 aa11.37□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.37□□□□□ -0.59
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HDLBP-241ENST00000487169 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.37□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.37□□□□□ -0.59
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