RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 IFNA2P01563 188 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM106CPP0CH98 169 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM11P17152 192 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CD1BP29016 333 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 THBS3P49746 956 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CCR6P51684 374 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 UCP3P55916 312 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 HES1Q14469 280 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 KIR3DS1Q14943 382 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 BVESQ8NE79 360 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5R1Q8NH85 324 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 JMJD8Q96S16 334 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PRRT1Q99946 306 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF19Q9Y242 345 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PLXNB1O43157 2135 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0A6YYJ9 748 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPXA8MT69 81 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LYRM1O43325 122 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CHST1O43916 411 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FCGR3BO75015 233 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX14O75381 377 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MOSP00540 346 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 APOA2P02652 100 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CNTFRP26992 372 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MC5RP33032 325 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 BTCP35070 178 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00310P59036 64 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MSMO1Q15800 293 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD9Q7L273 389 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM86BQ8N661 226 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51H1Q8NH63 302 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 DDB2Q92466 427 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR132Q9UNW8 380 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 VSIG4Q9Y279 399 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN34H7C241 214 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM77I1YAP6 450 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR137BO60478 399 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1-16P04430 117 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RLN1P04808 185 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 F2RL1P55085 397 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 PIGPP57054 158 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 EBI3Q14213 229 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C16orf87Q6PH81 154 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 Q8N6K4 173 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 BORCS5Q969J3 196 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 MPPED1O15442 326 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2F2O95006 317 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYZL1O95825 349 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RRASP10301 218 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR1C4P17516 323 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 S100GP29377 79 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms