RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFHR2P36980 270 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR12P47775 334 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERF2P84101 59 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL10A1Q03692 680 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF561Q8N587 486 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 S100PBPQ96BU1 408 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR146Q96CH1 333 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX22Q96L94 193 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 NGBQ9NPG2 151 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC30A6NM36 301 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0YL77 283 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0R036 132 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB29O14966 203 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 CST7O76096 145 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF1AP19438 455 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF83P51522 516 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB5BP61020 215 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2KP61086 200 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 AESQ08117 197 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXF2Q12947 444 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GUCA2BQ16661 112 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUP37Q8NFH4 326 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01560Q8TB33 94 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB39BQ96DA2 213 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 WFDC1Q9HC57 220 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 MSL2Q9HCI7 577 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNG12Q9UBI6 72 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL19Q9UHD0 177 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUSP13Q9UII6 198 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRELID1Q9Y255 219 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ODAMA1E959 279 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGB1BP1O14713 200 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSPNO60542 156 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 NXPH3O95157 252 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOSR1O95249 250 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTRB1P17538 263 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTAFRP25105 342 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRDX2P32119 198 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 GATA4P43694 442 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASCL1P50553 236 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF9Q07011 255 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 EDDM3AQ14507 147 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 AVPI1Q5T686 147 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGFRL1Q8N441 504 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF709Q8N972 641 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR1L1Q8NH94 360 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2V2Q96R30 315 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FZR1Q9UM11 496 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM74A7A6NL05 159 aa5.23□□□□□ -1.57
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