RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 VAMP1P23763 118 aa16.53■□□□□ 0.24
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HOXA4-202ENST00000428284 SLC25A42Q86VD7 318 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 OR4S2Q8NH73 311 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 TNFRSF19Q9NS68 423 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 H0Y980 276 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 MOSP00540 346 aa16.52■□□□□ 0.24
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HOXA4-202ENST00000428284 C11orf88Q6PI97 169 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 OR5R1Q8NH85 324 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 PIFOQ8TCI5 191 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXA4-202ENST00000428284 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.52■□□□□ 0.24
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HOXA4-202ENST00000428284 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R1AQ13522 171 aa16.51■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 TCF19Q9Y242 345 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 TMEM219Q86XT9 240 aa16.51■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 SHOXO15266 292 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 B3GALNT1O75752 331 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINE2P07093 398 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 OR4E1P0C645 316 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 ANXA3P12429 323 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 RPS16P62249 146 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 EBI3Q14213 229 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM16LQ309B1 348 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 GALNT14Q96FL9 552 aa16.5■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 TMEM177Q53S58 311 aa16.49■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 CUBNO60494 3623 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 S1PR2O95136 353 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 SFT2D2O95562 160 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 HPRT1P00492 218 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 DHRS2Q13268 280 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 MMDQ15546 238 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF585BQ52M93 769 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM222Q9H0R3 208 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 PRR13Q9NZ81 148 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 A6NDX4 124 aa16.47■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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HOXA4-202ENST00000428284 Q8N6K4 173 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHA2Q9HB19 425 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf170A2RU37 121 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 CNTFRP26992 372 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 RAG2P55895 527 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 HILS1P60008 231 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM187Q14656 261 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 OR52B4Q8NGK2 314 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 RNF5Q99942 180 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 CHIAQ9BZP6 476 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 ESM1Q9NQ30 184 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 COMMD9Q9P000 198 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXA4-202ENST00000428284 OR2F2O95006 317 aa16.46■□□□□ 0.23
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