RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CLDN14O95500 239 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C1QTNF9P0C862 333 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 VDAC1P21796 283 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SLAQ13239 276 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GUCA2BQ16661 112 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SPSB1Q96BD6 273 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PLPPR2Q96GM1 343 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 THYN1Q9P016 225 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCA4P78363 2273 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SDK2Q58EX2 2172 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 APOMO95445 188 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 EPPINO95925 133 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CXorf1O96002 111 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV3-11P04433 115 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM157CP0CG43 387 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CTLA4P16410 223 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FUT3P21217 361 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CT83Q5H943 113 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 Q8WTZ3 238 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ASB10Q8WXI3 467 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2FQ969M7 185 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 DIRC2Q96SL1 478 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBA4BQ9H853 241 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NINQ8N4C6 2090 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SIP14410 1827 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 hADV38S2A0JD32 116 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF815PA8K554 130 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 E9PLN8 166 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFPL1O95159 310 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM50AO95807 157 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CEACAM3P40198 252 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MDP1Q86V88 176 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC01560Q8TB33 94 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ABHD1Q96SE0 405 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL19Q99731 98 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GNB4Q9HAV0 340 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GP6Q9HCN6 339 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CLN8Q9UBY8 286 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LRP12Q9Y561 859 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MS4A18H0YCH9 400 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BUT2 72 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 J3QKU1 62 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1D-16P01601 117 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MGAT2Q10469 447 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDX4Q13162 271 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GAGE13Q4V321 117 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SPACA5Q96QH8 159 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF7Q9UBF6 113 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBD1Q9UJT1 453 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PAGE4O60829 102 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ADRA2AP08913 450 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MAS1LP35410 378 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM258P61165 79 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms