RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 NEUROG1Q92886 237 aa8.4□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.4□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 HLA-GP17693 338 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 Q6P435 159 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF596Q8TC21 504 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 GALNT14Q96FL9 552 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RNF222A6NCQ9 220 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 CD1BP29016 333 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SULT1A2P50226 295 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SPCS3P61009 180 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RHOVQ96L33 236 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM218A2RU14 115 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 REG1AP05451 166 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RNF126Q9BV68 326 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 A1L4Q6 167 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RHOBP62745 196 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SLC25A17O43808 307 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 GNLYP22749 145 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.39□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 UCP1P25874 307 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFA6P56556 154 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF146Q15072 292 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 FHITP49789 147 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 PRR27Q6MZM9 219 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 HCP5Q6MZN7 132 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 LCN2P80188 198 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 OR9G1Q8NH87 305 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TEPPQ6URK8 271 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ASCL4Q6XD76 172 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 H7BYZ3 331 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TM4SF5O14894 197 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.38□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 WISP2O76076 250 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 MORN2Q502X0 79 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 WDR86Q86TI4 376 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 NUP37Q8NFH4 326 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 K7EQM0 130 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV3-1P01715 115 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 BRS3P32247 399 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ECSCRQ19T08 205 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 FAM78BQ5VT40 261 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 OR4C12Q96R67 309 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 B2MP61769 119 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 LIPFP07098 398 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM8Q96KF7 97 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.37□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 SRRM5B3KS81 715 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 H0YIZ8 118 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 NAPSAO96009 420 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 DPRXA6NFQ7 191 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 ATP5J2P56134 94 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 PSG5Q15238 335 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 WIPF3A6NGB9 483 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 MC5RP33032 325 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 PAGE4O60829 102 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 CA7P43166 264 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 CSN1S1P47710 185 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM186Q96B77 213 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 RARRES2Q99969 163 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.36□□□□□ -1.07
TTPAL-202ENST00000372904 C11orf94C9JXX5 98 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms