RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 EBI3Q14213 229 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 OR4C13Q8NGP0 309 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 PITPNC1Q9UKF7 332 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 POMT1Q9Y6A1 747 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 H0Y980 276 aa22.28■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV4-59P01825 116 aa22.28■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM86BQ8N661 226 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 TCF19Q9Y242 345 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 CRYZL1O95825 349 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV1-16P04430 117 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM11P17152 192 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 BRWD1-AS2P59051 145 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 DHODHQ02127 395 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 GALNT14Q96FL9 552 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 RNF5Q99942 180 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-201ENST00000345425 PEX14O75381 377 aa22.26■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 ANXA3P12429 323 aa22.26■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TP53RKQ96S44 253 aa22.26■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RAMP3O60896 148 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINE2P07093 398 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 MECP2P51608 486 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM177Q53S58 311 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 HPRT1P00492 218 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 OR5AC1P0C628 307 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 OR4E1P0C645 316 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 VAMP1P23763 118 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RAG2P55895 527 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 HNF4GQ14541 408 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 JMJD8Q96S16 334 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 MARVELD1Q9BSK0 173 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 VPREB3Q9UKI3 123 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SHOXO15266 292 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RPS16P62249 146 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R1AQ13522 171 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 LY6EQ16553 131 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf46Q504U0 113 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 HARBI1Q96MB7 349 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHA2Q9HB19 425 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 A6NDX4 124 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 IFNA2P01563 188 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RPA2P15927 270 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SPNP16150 400 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RAB25P57735 213 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SP6Q3SY56 376 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 Q8N6K4 173 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM222Q9H0R3 208 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 BEX1Q9HBH7 125 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 UCP1P25874 307 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 LPAR6P43657 344 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 LGALS7P47929 136 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 HILS1P60008 231 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM16LQ309B1 348 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF585BQ52M93 769 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 OR8H1Q8NGG4 311 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0A6YYJ9 748 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SFT2D2O95562 160 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 GLYATL2Q8WU03 294 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 AIFM2Q9BRQ8 373 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF19Q9NS68 423 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 C1RLQ9NZP8 487 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 COMMD9Q9P000 198 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 OR2F2O95006 317 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 HRASP01112 189 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 MMDQ15546 238 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 FBLN7Q53RD9 439 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 C16orf82Q7Z2V1 217 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM219Q86XT9 240 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 MINDY2Q8NBR6 621 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A33Q9BSK2 321 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-201ENST00000345425 CLDN34H7C241 214 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 S1PR2O95136 353 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 DHFRP00374 187 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 DHRS2Q13268 280 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 OXA1LQ15070 435 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 LYG2Q86SG7 212 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 RITA1Q96K30 269 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 C9orf170A2RU37 121 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 SRPXP78539 464 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM187Q14656 261 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 RAB18Q9NP72 206 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1456Q9P272 454 aa22.2■■□□□ 1.14
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