RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 LCN2P80188 198 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 G6PC2Q9NQR9 355 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 PITPNC1Q9UKF7 332 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 S4R3C0 116 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 COMPP49747 757 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 LY75O60449 1722 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 CD99P14209 185 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 PSG9Q00887 426 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM177Q53S58 311 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 LIPFP07098 398 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R60P59551 318 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ZNRF1Q8ND25 227 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SELENOTP62341 195 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 OR9G1Q8NH87 305 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 KLK15Q9H2R5 256 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 RARRES2Q99969 163 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM27E3Q08E93 113 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM54Q969K7 222 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SH3BGRL3Q9H299 93 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TUBD1Q9UJT1 453 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TEX29Q8N6K0 151 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 MPDU1O75352 247 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 JPT1Q9UK76 154 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF9Q07011 255 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 DLX6P56179 175 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM10L1P0DMW3 83 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 RPL39P5Q59GN2 51 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM10Q96HG1 83 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 HSPB9Q9BQS6 159 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 OR51M1Q9H341 326 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 MOSP00540 346 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SPSB2Q99619 263 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A38Q96DW6 304 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A10PA6NDY2 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A18PA6NE21 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A16PA6NEW6 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A7PA6NKC0 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A22PA8MWA6 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A12PA8MX19 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A15PP0C7V4 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A13PP0C7W8 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A14PP0C7W9 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A24PP0C7X0 464 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF56Q15929 161 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 OR4C13Q8NGP0 309 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 RAXQ9Y2V3 346 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 MOB4Q9Y3A3 225 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 DNLZQ5SXM8 178 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TP53RKQ96S44 253 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00862A6NCI5 91 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM201AQ5SY85 155 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ELOVL5Q9NYP7 299 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PR77 199 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 Q96M66 194 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 B9A039 149 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 GDF9O60383 454 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 IFITM3Q01628 133 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 GPR82Q96P67 336 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 STAG3L2P0CL84 134 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 CRYBB3P26998 211 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 RELQ04864 619 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 OR5P3Q8WZ94 311 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 MEGF10Q96KG7 1140 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 FAM181AQ8N9Y4 354 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM262E9PQX1 116 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 NPPCP23582 126 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 NRIP2Q9BQI9 281 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 KLF4O43474 513 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf100Q5SVJ3 147 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM186Q96B77 213 aa19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms