RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBA2P53672 197 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD11O94819 623 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SSTR5P35346 364 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SMAGPQ0VAQ4 97 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF841Q6ZN19 808 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 HILPDAQ9Y5L2 63 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM250H0YL14 139 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CA2P00918 260 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 AMY1AP04745 511 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ARL14EPLP0DKL9 152 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 GLIPR1P48060 266 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 STPG1Q5TH74 334 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ASPHD2Q6ICH7 369 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 DYNLRB2Q8TF09 96 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PS18 150 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 PLAUP00749 431 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CKS2P33552 79 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JK05 382 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ZNHIT1O43257 154 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 LEPROTL1O95214 131 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 FTH1P19P0C7X4 201 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf68Q2NKX9 166 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf54Q6X4T0 127 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 DRAM1Q8N682 238 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A17O43808 307 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 NUBP1P53384 320 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 RPS20P60866 119 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC3Q8IUB2 231 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR51G1Q8NGK1 321 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR10J6PQ8NGY7 276 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BAQ96A08 127 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 PARLQ9H300 379 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 UQCR10Q9UDW1 63 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 RNF224P0DH78 156 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 METTL26Q96S19 204 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C46A6NHA9 309 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA45Q537H7 98 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ID4P47928 161 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR5P3Q8WZ94 311 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TM2D1Q9BX74 207 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 A6NJY4 79 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 MFAP4P55083 255 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR9G1Q8NH87 305 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM186Q96B77 213 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 GPR61Q9BZJ8 451 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 LPAR2Q9HBW0 351 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRFP10586 1907 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 RECKO95980 971 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ASXL3Q9C0F0 2248 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ZP1P60852 638 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF146Q15072 292 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 OR1N2Q8NGR9 330 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 GP6Q9HCN6 339 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 SPTBP11277 2137 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM177Q53S58 311 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF506Q5JVG8 444 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT14Q96FL9 552 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf92Q96LL3 132 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 DDTP30046 118 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00518Q8N0U6 118 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 GATAD1Q8WUU5 269 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 CA7P43166 264 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TCF21O43680 179 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 VENTXO95231 258 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBB3P26998 211 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 FHITP49789 147 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 EBLN2Q6P2I7 272 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 PSG9Q00887 426 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF502Q8TBZ5 544 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 NABP2Q9BQ15 211 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TRGC1P0CF51 173 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD12Q8N2K0 398 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 BTF3P20290 206 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 FOLR2P14207 255 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 SRIP30626 198 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms