RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PNR3 127 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 GFRA1P56159 465 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 MLF1P58340 268 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V0BQ99437 205 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 GNB4Q9HAV0 340 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 MPPED1O15442 326 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 UEVLDQ8IX04 471 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 FADS6Q8N9I5 356 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 OR1N2Q8NGR9 330 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 EMC6Q9BV81 110 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.53■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 CCL3P10147 92 aa18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 MC5RP33032 325 aa18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 MPV17L2Q567V2 206 aa18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 OR10J3Q5JRS4 329 aa18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 SPSB1Q96BD6 273 aa18.52■□□□□ 0.56
PITX1-201ENST00000265340 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 NPIPA5E9PKD4 350 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 FOLR3P41439 243 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 NMSQ5H8A3 153 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 DCAF12Q5T6F0 453 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 OR10W1Q8NGF6 305 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 OR1B1Q8NGR6 318 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 SFRP2Q96HF1 295 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 KCNK17Q96T54 332 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PROK2Q9HC23 129 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ALKBH4Q9NXW9 302 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 NPIPA1Q9UND3 350 aa18.52■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PS18 150 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 RHOBP62745 196 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ZNF205O95201 554 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 STAG3L3P0CL85 134 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ZNF525Q8N782 197 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.51■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PPIAL4EA0A075B759 164 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PPIAL4DF5H284 164 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 CD5LO43866 347 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PPIAL4FP0DN26 164 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 TLE1Q04724 770 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 HAPLN4Q86UW8 402 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 C5orf17Q8NAS9 161 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 MOB1AQ9H8S9 216 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ABI3Q9P2A4 366 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PCSK5Q92824 1860 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 CA2P00918 260 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PSG4Q00888 419 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ATOH7Q8N100 152 aa18.5■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 M0R1X1 148 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 C1QTNF9P0C862 333 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PMCHP20382 165 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 NPPCP23582 126 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 DAP3P51398 398 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 H0YJW9 148 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 FCN1O00602 326 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 IGLL1P15814 213 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 GDF1P27539 372 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 OTX2P32243 289 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 ZNF83P51522 516 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 Q0VFX4 171 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.49■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 MT-CO2P00403 227 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 VDAC1P21796 283 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 SSR4P51571 173 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 RRADP55042 308 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 KISS1Q15726 138 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 CT55Q8WUE5 264 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 BORCS7Q96B45 105 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC2LH3BP13 241 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 HERV-K104P61576 105 aa18.48■□□□□ 0.55
PITX1-201ENST00000265340 CRIP3Q6Q6R5 217 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms