RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H0YJW9 148 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FCGR3BO75015 233 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VENTXO95231 258 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM11P17152 192 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 S100GP29377 79 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IER3P46695 156 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIGPP57054 158 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COPZ2Q9P299 210 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCF21O43680 179 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ECI1P42126 302 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UCP3P55916 312 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEFA1P59665 94 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEFA3P59666 94 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CATR1Q13166 79 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CBX3Q13185 183 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASAH1Q13510 395 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTL8BQ17RB0 113 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ENKURQ8TC29 256 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHIAQ9BZP6 476 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCF19Q9Y242 345 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CRYZL1O95825 349 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM106CPP0CH98 169 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKR1C4P17516 323 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNTFRP26992 372 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIFOQ8TCI5 191 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BEX1Q9HBH7 125 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAB2Q9UQC2 676 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF212BA8MTL3 300 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VGLL3A8MV65 326 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MOSP00540 346 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGKV1-16P04430 117 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPA2P15927 270 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD1BP29016 333 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HILS1P60008 231 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR2T10Q8NGZ9 312 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR5R1Q8NH85 324 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HARBI1Q96MB7 349 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR132Q9UNW8 380 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A6NDX4 124 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SHOXO15266 292 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHST1O43916 411 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAMP3O60896 148 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDUFB6O95139 128 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DYNLT3P51808 116 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB25P57735 213 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMDQ15546 238 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSMO1Q15800 293 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SP6Q3SY56 376 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDPNQ86YL7 162 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4S2Q8NH73 311 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDB2Q92466 427 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms