RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DYSFO75923 2080 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN2O60636 221 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF79Q15937 498 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 HYPMO75409 117 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MPZL1O95297 269 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ANOS1P23352 680 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB103AP81534 67 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 H0Y980 276 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 GLIPR1P48060 266 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALNT1Q00973 533 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP2Q05923 314 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 GGTLC2Q14390 218 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GTL3 188 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CXCL2P19875 107 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MPLP40238 635 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CA7P43166 264 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 EFNB2P52799 333 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SSPNQ14714 243 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PRNTQ86SH4 94 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PAGE4O60829 102 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM238C9JI98 176 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 J3QR06 171 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB7O75200 414 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 GAPTQ8N292 157 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO17Q96EF6 278 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PLXNB1O43157 2135 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 IFITM2Q01629 132 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF774Q6NX45 483 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ALG14Q96F25 216 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ATXN8Q156A1 80 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF56Q15929 161 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 HOGA1Q86XE5 327 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf30Q96GV9 206 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ASB16Q96NS5 453 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CTLA4P16410 223 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V0CP27449 155 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RLN3Q8WXF3 142 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 F8WEM9 126 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PAX2Q02962 417 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0040Q15053 153 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GUCA2BQ16661 112 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CHST5Q9GZS9 411 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CA6P23280 308 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms