RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	UCP3	P55916	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	HNF4G	Q14541	408 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	MSMO1	Q15800	293 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	LINC00473	A8K010	186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870		H0YJW9	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	MOS	P00540	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	RLN1	P04808	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	MC5R	P33032	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CATR1	Q13166	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CBX3	Q13185	183 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	BVES	Q8NE79	360 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870		A6NDX4	124 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	PLA2G10	O15496	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	LYRM1	O43325	122 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CCR6	P51684	374 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	PDPN	Q86YL7	162 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	ZFHX3	Q15911	3703 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CLDN34	H7C241	214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	GPR137B	O60478	399 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	FCGR3B	O75015	233 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	PEX14	O75381	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RRAS	P10301	218 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	PIGP	P57054	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	IFITM3	Q01628	133 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CHST1	O43916	411 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	CRYZL1	O95825	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	ASAH1	Q13510	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	EBI3	Q14213	229 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	MMD	Q15546	238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	POC5	Q8NA72	575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	DDB2	Q92466	427 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	GPR132	Q9UNW8	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	VSIG4	Q9Y279	399 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF25-223	ENST00000568870	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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