RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	CCL19	Q99731	98 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PECR	Q9BY49	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SRR	Q9GZT4	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	RHOF	Q9HBH0	211 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	DUX4	Q9UBX2	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0A6YYH2	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0U1RQK1	487 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF320	A2RRD8	509 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934		A6NJ64	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934		K7N7A8	449 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	LANCL1	O43813	399 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SSX5	O60225	188 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PDCD6	O75340	191 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	FSTL3	O95633	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MT-ND4	P03905	459 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	WNT2	P09544	360 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CD3G	P09693	182 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CSF3	P09919	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF44	P15621	663 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS3	P35030	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TALDO1	P37837	337 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF45	Q02386	682 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	AES	Q08117	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	IL18	Q14116	193 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CARTPT	Q16568	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PYDC2	Q56P42	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	STUM	Q69YW2	141 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF525	Q8N782	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	S100Z	Q8WXG8	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	RAB1C	Q92928	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SDSL	Q96GA7	329 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CHST6	Q9GZX3	395 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	AK3	Q9UIJ7	227 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		3.56	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ARID1A	O14497	2285 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MED13L	Q71F56	2210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ISPD	A4D126	451 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINE3	A8MV23	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SIGLEC5	O15389	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ORC5	O43913	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	RBBP9	O75884	186 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SCGN	O76038	276 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GLA	P06280	429 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GIF	P27352	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CD40LG	P29965	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GNG2	P59768	71 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PITPNA	Q00169	270 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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