RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778		H0YJW9	148 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	FCN1	O00602	326 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	TNFSF12	O43508	249 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	TUSC2	O75896	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5H8	P0DN80	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	NAT1	P18440	290 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	ARHGDIB	P52566	201 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	ACTB	P60709	375 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	DGCR2	P98153	550 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778		Q8N2B8	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778		Q8N9W7	124 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	S1PR3	Q99500	378 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	RAB18	Q9NP72	206 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	IFT46	Q9NQC8	304 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778		H7C2Y5	167 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778		M0QYG6	137 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	TXNL1	O43396	289 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	CTXN2	P0C2S0	81 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	CD28	P10747	220 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	HRH1	P35367	487 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	FXYD4	P59646	89 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	CDK10	Q15131	360 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	BVES	Q8NE79	360 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	SOST	Q9BQB4	213 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	EHF	Q9NZC4	300 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	GAB2	Q9UQC2	676 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-222	ENST00000556778	DIRAS3	O95661	229 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	PPY	P01298	95 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	GNRHR	P30968	328 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	CBX5	P45973	191 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	DYRK1A	Q13627	763 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	MMD	Q15546	238 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF329	Q86UD4	541 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	DDB2	Q92466	427 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	CLCC1	Q96S66	551 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	GHITM	Q9H3K2	345 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	FBXL15	Q9H469	300 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GUS0	222 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	FABP12	A6NFH5	140 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5H14	A6NHG9	310 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLV2-23	P01705	113 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	CD3D	P04234	171 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	IL18	Q14116	193 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	PSG5	Q15238	335 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM17	Q86X19	198 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	NPB	Q8NG41	125 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKCH-222	ENST00000556778	CITED1	Q99966	193 aa		6.95	□□□□□ -1.3

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