RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 S1PR3Q99500 378 aa14.79□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 RAB18Q9NP72 206 aa14.79□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.79□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 ZNF221Q9UK13 617 aa14.79□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 OPN1MWP04001 364 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 ETV6P41212 452 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 TAS2R46P59540 309 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 Q6ZS46 218 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 ZNF383Q8NA42 475 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 BATF3Q9NR55 127 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 EHFQ9NZC4 300 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.78□□□□□ -0.04
PUF60-218ENST00000531995 H0YJW9 148 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 M0QYG6 137 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OR2F2O95006 317 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 PPYP01298 95 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 CD3DP04234 171 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 S100A5P33763 92 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 BLCAPP62952 87 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 HNF4GQ14541 408 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ZNF702PQ9H963 129 aa14.77□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 M0R1X1 148 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 CD74P04233 296 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TMEM11P17152 192 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 C11orf88Q6PI97 169 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 FBXO24O75426 580 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 MOSP00540 346 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 F2RL1P55085 397 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ACTBP60709 375 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 HES1Q14469 280 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 DDB2Q92466 427 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 MOB3AQ96BX8 217 aa14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 LINC00473A8K010 186 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ZNF735P0CB33 412 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 CD28P10747 220 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 Q8N2B8 174 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 GPHA2Q96T91 129 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SRRQ9GZT4 340 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OR5H14A6NHG9 310 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 CNTFRP26992 372 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 GNRHRP30968 328 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 FXYD4P59646 89 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 MSMO1Q15800 293 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 ACTBL2Q562R1 376 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 PYDC2Q56P42 97 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 Q8N9W7 124 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TRIM63Q969Q1 353 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 SLC22A5O76082 557 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 IGKV1-16P04430 117 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TBPP20226 339 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 MC5RP33032 325 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 THBS3P49746 956 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 TAS2R19P59542 299 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-218ENST00000531995 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms