RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 WASHC3Q9Y3C0 194 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 J3QRK9 145 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 M0QZK8 103 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 OR2F2O95006 317 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 MOSP00540 346 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV2-14P01704 120 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 DUTP33316 252 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CATR1Q13166 79 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 BAK1Q16611 211 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 AADACL3Q5VUY0 350 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 KCTD9Q7L273 389 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 BVESQ8NE79 360 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CCL28Q9NRJ3 127 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 NAP1L6A6NFF2 107 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 RNF212BA8MTL3 300 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 H0YJW9 148 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 GPR137BO60478 399 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM11P17152 192 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 LY6EQ16553 131 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 RTL8BQ17RB0 113 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 PRIMA1Q86XR5 153 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 DUX5Q96PT3 197 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 MCUBQ9NWR8 336 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CENPXA8MT69 81 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 GPR31O00270 319 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CRYBA1P05813 215 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF735P0CB33 412 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 GNRHRP30968 328 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 C5orf30Q96GV9 206 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 RNF5Q99942 180 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 H7C2Y5 167 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 KIR2DS2P43631 304 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF383Q8NA42 475 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 C1RLQ9NZP8 487 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 ZFHX3Q15911 3703 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CUBNO60494 3623 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 FGF16O43320 207 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CD24P25063 80 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 Q8N6K4 173 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 DDB2Q92466 427 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 PGAM2P15259 253 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM219Q86XT9 240 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 POC5Q8NA72 575 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00473A8K010 186 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 CHST1O43916 411 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 SPDEFO95238 335 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 RND3P61587 244 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 OR4S2Q8NH73 311 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA1456Q9P272 454 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 TNFSF12O43508 249 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 RLN1P04808 185 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 LGALS7P47929 136 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 MMDQ15546 238 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM177Q53S58 311 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-218ENST00000525459 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms