RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 NRN1Q9NPD7 142 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 COX11Q9Y6N1 276 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.36□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 MYO7AQ13402 2215 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1W2PR77 199 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CLDN14O95500 239 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 PPBPP02775 128 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 STAG3L2P0CL84 134 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 STAG3L3P0CL85 134 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CDKN1AP38936 164 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP5G3P48201 142 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 AMTP48728 403 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 PRRX1P54821 245 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 RHOBP62745 196 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 GNG3P63215 75 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 IGFBP7Q16270 282 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 RASL11AQ6T310 242 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TCF23Q7RTU1 214 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf52Q96A22 123 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 APH1AQ96BI3 265 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 SGCZQ96LD1 299 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A0J9YW62 118 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 DPRXA6NFQ7 191 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 HSPB6O14558 160 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CDIPTO14735 213 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 HYPMO75409 117 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 NXPH2O95156 264 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 IGLV2-14P01704 120 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 AREGP15514 252 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 HNF1AP20823 631 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CBLN1P23435 193 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFSF4P23510 183 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TFPI2P48307 235 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 CARD18P57730 90 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00310P59036 64 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TDRG1Q3Y452 100 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 STUMQ69YW2 141 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 DRAM1Q8N682 238 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 OCC1Q8TAD7 63 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM45BQ96B21 275 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.34□□□□□ -1.39
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAMTS20P59510 1910 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GUS0 222 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 ODAMA1E959 279 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF716A6NP11 495 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 CCL25O15444 150 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 ZIC3O60481 467 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 SCRG1O75711 98 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAPPC6AO75865 159 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 CRYAAP02489 173 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 CA3P07451 260 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 P0C879 139 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 SRD5A2P31213 254 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 IER3P46695 156 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 SSR4P51571 173 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 CX3CL1P78423 397 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 TFF3Q07654 80 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 SSPNQ14714 243 aa6.33□□□□□ -1.4
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms