RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM162BQ5T6X4 162 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZS92 163 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLCZ1Q86YW0 608 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MITD1Q8WV92 249 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NELFBQ8WX92 580 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5P2Q8WZ92 322 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED18Q9BUE0 208 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHST6Q9GZX3 395 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51B6Q9H340 312 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JPT1Q9UK76 154 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-1.07□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM64CA6NLI5 447 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC14L6B5MCN3 397 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 I3L4J1 428 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GATCO43716 136 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF682O95780 498 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFPTP0C1Z6 253 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALDH3A1P30838 453 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSKP41240 450 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLCO1A2P46721 670 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAS2R45P59539 299 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB4BP61018 213 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XRCC4Q13426 336 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D28Q2M2D7 210 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LUZP2Q86TE4 346 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GKN2Q86XP6 184 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OFCC1Q8IZS5 231 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPICQ8N5J4 248 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1M1Q8NGA1 313 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51L1Q8NGJ5 315 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPD52L3Q96J77 140 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFA3Q9BQP9 254 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YIPF3Q9GZM5 350 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC12Q9UKB3 198 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STRCQ7RTU9 1775 aa-1.08□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A087WUU8 490 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0J9YW62 118 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HYPMO75409 117 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRMP19623 302 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMB8P28062 276 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTR1BP42025 376 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRA2P47869 451 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPINT3P49223 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SULT1A2P50226 295 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMP1P54849 157 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSG9Q00887 426 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCUR1Q96AQ8 359 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D31Q96DN5 1066 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABHD14BQ96IU4 210 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51E2Q9H255 320 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAT8Q9UHE5 227 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC12Q96J65 1359 aa-1.09□□□□□ -2.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf70A6NJV1 201 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL25O15444 150 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKR7A2O43488 359 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WBP4O75554 376 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIB2O75838 187 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMP2P02689 132 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD3DP04234 171 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRS3P32247 399 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN5P62079 268 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTF2BQ00403 316 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKR1C1Q04828 323 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPWQ5EE01 88 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00575Q6W349 94 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATOH7Q8N100 152 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3orf56Q8N813 242 aa-1.1□□□□□ -2.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC112Q8NEF3 446 aa-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms