RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RETNQ9HD89 108 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM100Q9NV29 134 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf109Q9NX04 203 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 CENPBD1B2RD01 187 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 H3BSH0 61 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 K7EQG2 157 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 GMDSO60547 372 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 RBBP9O75884 186 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 LALBAP00709 142 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 HLA-DPB1P04440 258 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 ERFP50548 548 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP10-1P60331 282 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 RPL38P63173 70 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 TRAM2Q15035 370 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 ARL6IP1Q15041 203 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 OR2T2Q6IF00 324 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 OR6X1Q8NH79 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 MPPED2Q15777 294 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 CD177Q8N6Q3 437 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-217ENST00000509355 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 OR56B4Q8NH76 319 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM239Q8WW34 195 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 TM2D1Q9BX74 207 aa3.24□□□□□ -1.89
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