RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 POC5Q8NA72 575 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 CFHR4Q92496 578 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 DUX5Q96PT3 197 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 C1RLQ9NZP8 487 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZFHX3Q15911 3703 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 M0QZK8 103 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR2F2O95006 317 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 VENTXO95231 258 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 CD24P25063 80 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 KIR2DS2P43631 304 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RIPPLY3P57055 190 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 KCTD9Q7L273 389 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PDPNQ86YL7 162 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 CHIAQ9BZP6 476 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 KIAA1456Q9P272 454 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 A6NDX4 124 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 H0YJW9 148 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 TNFSF12O43508 249 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 GPR137BO60478 399 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 GNRHRP30968 328 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 EBI3Q14213 229 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 HNF4GQ14541 408 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 C11orf88Q6PI97 169 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF383Q8NA42 475 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 BVESQ8NE79 360 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PIFOQ8TCI5 191 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 TSC22D3Q99576 134 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RNF5Q99942 180 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ESM1Q9NQ30 184 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 COPZ2Q9P299 210 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 NF1P21359 2839 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 FCGR3BO75015 233 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF735P0CB33 412 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 DEFA1P59665 94 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 DEFA3P59666 94 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM219Q86XT9 240 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 OR4S2Q8NH73 311 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 SHOXO15266 292 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PROP1O75360 226 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 UPK1BO75841 260 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV2-14P01704 120 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RLN1P04808 185 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 LGALS7P47929 136 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PIGPP57054 158 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PLGLAQ15195 96 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 MMDQ15546 238 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGA3-210ENST00000507771 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms